Le CESN est réparti sur deux sites :

Centre d'Étude des Substances Naturelles
Pôle recherche et enseignement
Site La Doua
Bâtiment Forel, 4eme étage
43 boulevard du 11 novembre 1918
69622 Villeurbanne Cedex
Plan Campus La Doua

Centre d'Étude des Substances Naturelles
Pôle enseignement
Site Rockefeller
Pavillon Nétien, 2eme étage
8 av. Rockefeller
69373 LYON
Plan Campus Rockefeller